MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia garinii NMJW1 chromosome

Total Repeats: 1997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018747	ATTT	2	8	8	15	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018747	ACT	2	6	34	39	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018747	TCT	2	6	558	563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018747	ATATA	2	10	603	612	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018747	TTA	2	6	3171	3176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018747	A	7	7	3185	3191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018747	ATT	2	6	3224	3229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018747	ATT	2	6	3231	3236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018747	AAT	2	6	3242	3247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018747	GAA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018747	ATA	2	6	5089	5094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018747	TAA	2	6	5127	5132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018747	TTC	2	6	5139	5144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018747	T	6	6	7294	7299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018747	AATTT	2	10	8206	8215	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018747	TTAT	2	8	8231	8238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018747	AT	3	6	8237	8242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018747	TAT	2	6	8247	8252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018747	TAA	2	6	8265	8270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018747	ATA	2	6	15539	15544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018747	A	9	9	15558	15566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018747	TA	3	6	15592	15597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018747	ATA	2	6	15623	15628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018747	A	8	8	15631	15638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018747	A	7	7	15640	15646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018747	T	8	8	15660	15667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018747	ATT	2	6	15694	15699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018747	TCC	2	6	19871	19876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018747	TAAT	2	8	19877	19884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018747	TAAAT	2	10	19885	19894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018747	AAT	2	6	19923	19928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018747	TAA	2	6	22039	22044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018747	AATTA	2	10	22638	22647	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018747	TAAA	2	8	22684	22691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018747	A	7	7	22689	22695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018747	TAA	2	6	25514	25519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018747	ACT	2	6	25566	25571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018747	ATTT	2	8	25592	25599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018747	TAA	2	6	25607	25612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018747	ATA	2	6	25619	25624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018747	ATA	2	6	31422	31427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018747	TTA	2	6	31979	31984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018747	A	6	6	32019	32024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018747	TAA	2	6	36350	36355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018747	A	6	6	36371	36376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018747	A	10	10	36403	36412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018747	TCAAAA	2	12	36413	36424	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018747	TTA	2	6	37860	37865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018747	TGCT	2	8	37882	37889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018747	A	6	6	37901	37906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018747	A	8	8	37911	37918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018747	ATTA	2	8	37988	37995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018747	CATT	2	8	38022	38029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018747	AAC	2	6	39537	39542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018747	TAA	2	6	39546	39551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018747	TAA	2	6	39562	39567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018747	ACT	2	6	39572	39577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018747	ATT	2	6	39597	39602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018747	A	6	6	39651	39656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018747	TA	3	6	40617	40622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018747	ATTT	2	8	40625	40632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018747	ATG	2	6	40651	40656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018747	ATA	2	6	41332	41337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018747	A	6	6	45268	45273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018747	TAA	2	6	45281	45286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018747	TAA	2	6	45305	45310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018747	TAA	2	6	45892	45897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018747	TCC	2	6	46278	46283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018747	AATT	2	8	46318	46325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018747	A	10	10	46336	46345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018747	ACA	2	6	46367	46372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018747	T	8	8	46394	46401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018747	ATT	2	6	46412	46417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018747	ATG	2	6	46465	46470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018747	ATA	2	6	46499	46504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018747	GATA	2	8	46555	46562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018747	AAAT	2	8	46571	46578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018747	TTTA	2	8	46647	46654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018747	ACC	2	6	46682	46687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018747	AAGC	2	8	46739	46746	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018747	CT	3	6	46797	46802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018747	ACA	2	6	46971	46976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018747	TAC	2	6	46978	46983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018747	ATT	2	6	46984	46989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018747	TAA	3	9	47014	47022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018747	AATA	2	8	47736	47743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018747	A	6	6	47743	47748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018747	TAAT	2	8	47761	47768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018747	GTC	2	6	49171	49176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018747	AT	3	6	49183	49188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018747	TA	3	6	49210	49215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018747	TAA	2	6	49899	49904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018747	TAA	2	6	49980	49985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018747	TTA	2	6	52317	52322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018747	TCC	2	6	53355	53360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_018747	T	8	8	53363	53370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018747	TTA	2	6	53390	53395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018747	TAA	2	6	53406	53411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018747	AAT	2	6	56645	56650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018747	AT	3	6	56653	56658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018747	TAAT	3	12	56688	56699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018747	TTATT	2	10	56700	56709	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018747	C	6	6	57080	57085	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_018747	TAA	3	9	57119	57127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018747	TTA	2	6	57877	57882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018747	ATTT	2	8	58934	58941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018747	ATT	3	9	58953	58961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018747	T	6	6	59305	59310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018747	A	7	7	59311	59317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018747	A	7	7	60433	60439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018747	TTA	2	6	62893	62898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018747	A	7	7	62905	62911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018747	TA	3	6	62919	62924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018747	AAT	2	6	62946	62951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018747	A	13	13	62961	62973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018747	AGG	2	6	65150	65155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018747	A	6	6	65632	65637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018747	GAAA	2	8	70013	70020	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018747	AAAT	2	8	70021	70028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018747	AT	3	6	70027	70032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018747	AACA	2	8	72507	72514	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018747	A	6	6	79215	79220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018747	A	7	7	79246	79252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018747	A	8	8	79268	79275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018747	ATT	2	6	79278	79283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018747	TAA	2	6	79287	79292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018747	T	7	7	79304	79310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018747	A	6	6	79318	79323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018747	AAAAAT	2	12	80655	80666	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018747	TCTT	3	12	80688	80699	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018747	TAA	2	6	80724	80729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018747	ATT	2	6	80732	80737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018747	A	6	6	80778	80783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018747	TTTA	2	8	80786	80793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018747	TAT	2	6	80804	80809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018747	T	6	6	80809	80814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018747	ATT	2	6	80815	80820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018747	TAA	2	6	80825	80830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018747	AAAAT	3	15	80838	80852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018747	TTC	2	6	81988	81993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018747	ACAA	2	8	82002	82009	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018747	ATA	2	6	82068	82073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018747	A	6	6	82113	82118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018747	AAT	2	6	82121	82126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018747	TACAA	2	10	83820	83829	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_018747	C	6	6	85724	85729	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
147	NC_018747	ATTAA	2	10	86743	86752	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018747	ATA	2	6	86788	86793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018747	TTA	2	6	93920	93925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018747	TTAAC	2	10	93941	93950	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_018747	CAAA	2	8	93960	93967	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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